Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb4A2A863 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms