Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71e1A1L3C1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71e1A1L3C1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms