Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc173A0JLY1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms