Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc112A0AUP1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc112A0AUP1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms