Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap99A0A140LIX9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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