Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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