Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms