Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smarca2Q6DIC0 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms