Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxd13P70217 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxd13P70217 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxd13P70217 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxd13P70217 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxd13P70217 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxd13P70217 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxd13P70217 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxd13P70217 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxd13P70217 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms