Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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