Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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