Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ccdc6D3YZP9 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms