Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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