Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Rabgef1Q9JM13 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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Rabgef1Q9JM13 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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Rabgef1Q9JM13 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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Rabgef1Q9JM13 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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