Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Atg4aQ8C9S8 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Atg4aQ8C9S8 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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