Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Snx27Q3UHD6 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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Snx27Q3UHD6 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Snx27Q3UHD6 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Snx27Q3UHD6 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Snx27Q3UHD6 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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