Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms