Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 CT009536.1-201ENSMUST00000223774 2151 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm43836-201ENSMUST00000196532 381 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm42634-201ENSMUST00000197362 381 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Cpne8-202ENSMUST00000064391 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Tyms-201ENSMUST00000026846 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Zfp563-201ENSMUST00000131722 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Fgf13-202ENSMUST00000119306 2091 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Cd300e-201ENSMUST00000062787 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
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Lrrc43Q3V0L5 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Olfr654-203ENSMUST00000213984 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 3632451O06Rik-202ENSMUST00000118129 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.2 ms