Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Sept2-213ENSMUST00000168776 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm7389-201ENSMUST00000181162 2884 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Zp2-201ENSMUST00000033207 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Pcdhga1-202ENSMUST00000194888 3247 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Arpp21-230ENSMUST00000172380 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 C78197-201ENSMUST00000152781 3417 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Brinp3-205ENSMUST00000166814 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 F730016J06Rik-202ENSMUST00000128888 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Smpd4-209ENSMUST00000165363 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Rhpn2-202ENSMUST00000085556 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm12117-201ENSMUST00000183831 456 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Triml2-204ENSMUST00000210136 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Adam9-201ENSMUST00000084032 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Etfdh-202ENSMUST00000120992 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm1070-201ENSMUST00000114185 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Zfp750-201ENSMUST00000092298 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Nup107-202ENSMUST00000167943 3098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Mrpl15-206ENSMUST00000156816 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm28250-201ENSMUST00000187025 2168 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm37157-201ENSMUST00000192120 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm37112-201ENSMUST00000194389 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Olfr173-202ENSMUST00000206205 2778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms