Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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