Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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Gm5538W4VSP6 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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Gm5538W4VSP6 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm5538W4VSP6 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm5538W4VSP6 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm5538W4VSP6 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm5538W4VSP6 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm5538W4VSP6 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm5538W4VSP6 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm5538W4VSP6 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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