Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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