Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms