Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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