Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj3-202ENSMUST00000112632 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Vwa3b-203ENSMUST00000117172 1636 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 C330002G04Rik-201ENSMUST00000181623 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14855-201ENSMUST00000119925 192 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10637-201ENSMUST00000183718 828 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27353-201ENSMUST00000184712 122 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 AC118222.1-201ENSMUST00000222184 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Scml2-204ENSMUST00000087090 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Tars-201ENSMUST00000022849 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Parp9-202ENSMUST00000114877 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh15-210ENSMUST00000125517 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm10482-202ENSMUST00000189825 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 4932438H23Rik-202ENSMUST00000114076 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Platr1-201ENSMUST00000188474 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Prss35-202ENSMUST00000179574 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Ube2v1-201ENSMUST00000060645 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gtpbp6Q3U6U5 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Wdcp-206ENSMUST00000223551 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ptafr-201ENSMUST00000070690 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc17-204ENSMUST00000111238 4590 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh1a1-201ENSMUST00000087638 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr169-202ENSMUST00000215040 2316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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