Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Msx2Q03358 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms