Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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