Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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Trim12aQ99PQ1 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Trim12aQ99PQ1 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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