Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Irx1P81068 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Irx1P81068 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Irx1P81068 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Irx1P81068 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
Irx1P81068 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Irx1P81068 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Irx1P81068 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Irx1P81068 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Irx1P81068 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Irx1P81068 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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