Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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