Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Top1mtQ8R4U6 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Top1mtQ8R4U6 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Top1mtQ8R4U6 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Top1mtQ8R4U6 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Top1mtQ8R4U6 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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Top1mtQ8R4U6 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Top1mtQ8R4U6 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Top1mtQ8R4U6 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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