Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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