Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40117-201ENSMUST00000198827 369 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 AC156576.1-201ENSMUST00000222315 500 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Lkaaear1-201ENSMUST00000052416 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mrgpra6-201ENSMUST00000073793 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 4430402I18Rik-208ENSMUST00000179171 2638 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Parvb-201ENSMUST00000023072 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mad2l1-201ENSMUST00000101343 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Prom1-214ENSMUST00000197706 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44986-201ENSMUST00000206292 2829 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Rai14-202ENSMUST00000169385 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Vps8-203ENSMUST00000115397 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Pttg1-204ENSMUST00000117446 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Thnsl1-201ENSMUST00000054591 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh7a1-208ENSMUST00000174518 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Trim2-201ENSMUST00000054990 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Stmn2-201ENSMUST00000029002 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4b-201ENSMUST00000169681 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Usp28-201ENSMUST00000047349 4133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 CU074400.1-201ENSMUST00000224411 220 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb6a-202ENSMUST00000043552 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5c1b-202ENSMUST00000118657 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ltf-201ENSMUST00000035077 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1506-201ENSMUST00000213994 2495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Nbr1-206ENSMUST00000107213 4339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Mavs-201ENSMUST00000041362 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Spata31d1b-201ENSMUST00000165133 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ap3b1-201ENSMUST00000022196 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Steap4-201ENSMUST00000115421 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21569-201ENSMUST00000222683 2036 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Pparg-201ENSMUST00000000450 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Il12b-202ENSMUST00000170513 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ptges-202ENSMUST00000102852 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms