Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Usp29Q9ES63 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms