Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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