Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Erg-204ENSMUST00000118113 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem175-203ENSMUST00000120327 1811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ppwd1-201ENSMUST00000022226 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2j9-201ENSMUST00000055693 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Trim9-201ENSMUST00000110520 4156 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Dpy19l4-201ENSMUST00000084892 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Syt11-202ENSMUST00000107503 3575 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9050-201ENSMUST00000119501 448 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45827-201ENSMUST00000211955 311 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42572-201ENSMUST00000202292 3378 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10644-201ENSMUST00000098595 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl6-209ENSMUST00000228727 2388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mageb2-202ENSMUST00000201779 1551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Epn2-201ENSMUST00000001063 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Drosha-201ENSMUST00000090292 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8464-201ENSMUST00000140208 2200 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4750-202ENSMUST00000152262 2200 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10619-202ENSMUST00000186073 3287 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11548-201ENSMUST00000140203 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn1-201ENSMUST00000023154 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr582-204ENSMUST00000214021 3108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Frk-201ENSMUST00000019913 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43041-201ENSMUST00000200022 2630 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8087-201ENSMUST00000119091 567 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15465-201ENSMUST00000120368 358 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29371-201ENSMUST00000186823 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms