Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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