Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Trafd1Q3UDK1 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms