Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 507.9 ms