Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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