Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Usp27Q8CEG8 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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Usp27Q8CEG8 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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Usp27Q8CEG8 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Usp27Q8CEG8 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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Usp27Q8CEG8 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp27Q8CEG8 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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