Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms