Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms