Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
XntrpcF8VQM8 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms