Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms