Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms