Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gria4Q9Z2W8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria4Q9Z2W8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms