Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms