Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tulp1Q9Z273 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tulp1Q9Z273 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms