Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn7Q9Z261 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn7Q9Z261 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms